西安市计算生物信息学重点实验室成立于2019年5月。从事计算机、数学与生物医学学科的交叉研究，主要方向包括计算生物信息学，数据挖掘与机器学习，图论与组合优化等。实验室设有组学数据挖掘与分析研究室、靶向药物发现与预测研究室、疾病智能辅助诊断研究室、智能医学影像分析研究室，得到多项国家自然科学基金重点项目、重大研究计划和面上等项目，科技部国家重点研发计划重点专项。2012年，高琳教授创建了西部第一家以生物信息学为主的研究机构“计算生物信息学研究所”。已培养博士40余人，硕士220余人。4人荣获“陕西省优秀博士论文”，5人荣获“西安电子科技大学优秀博士论文”，1人荣获西安电子科技大学首届“校长奖学金”。

团队成员在《Nature Communications》、《Advanced Science》、《Nucleic Acids Research》、《Bioinformatics》、《Human Molecular Genetics》、《Briefings in Bioinformatics》、《IEEE/ACM TCBB》等期刊发表论文200余篇。2019年荣获陕西省自然科学一等奖，入选“2019年中国生物信息学十大算法与工具”， 2015年荣获电子学会自然科学二等奖等奖励。

西安市计算生物信息学重点实验室坚持“立足西部、育人育才、服务引领、团结实干”的发展思路，依托西安电子科技大学 “计算机科学与技术”双一流学科。始终坚持面向世界科技前沿、面向国家重大需求、面向西安地方科技发展主战场，坚持以信息为优势特色的交叉学科研究，培养产出高层次交叉学科人才。加强从0到1原始创新研究，用科技创新促进西安区域科技发展，本着西电人“团结勤奋，求实创新”的理念，潜心科研，创新务实。